INVESTIGADOR PRINCIPAL
EQUIPO DE INVESTIGACIÓN
David Posada González, Rafael Zardoya San Sebastian.
ENTIDAD ASOCIADA
DESCRIPCIÓN
Este proyecto se propone suplir la carencia de herramientas para seleccionar modelos adecuados desarrollando una herramienta bioinformática para seleccionar los modelos de sustitución de aminoácidos en alineaciones de proteínas más adecuados. Utilizando la teoría de la información, esta herramienta implementará también el diagnóstico para evaluar la incertidumbre de selección del modelo y la inferencia multimodelo. Se empleará un marco estadístico para seleccionar modelos de evolución de proteínas. Se aplicará la herramienta a diversas alineaciones de proteínas para estudiar los patrones de sustitución de aminoácidos en el genoma mitocondrial y en diferentes líneas de vertebrados. Ello nos permitirá validar su uso y, al mismo tiempo, estudiar los cambios en situaciones de restricción funcional en aquellas proteínas que evolucionan bajo diferentes esquemas de sustitución. Por último, crearemos un servidor web desde el que los investigadores puedan descargar esta herramienta bioinformática y analizar sus datos online.