‘Data minig of virus-host systems to understand regulatory interactions’

Domènec Farré Marimon, Mª del Mar Albà Soler, Paul Kellam.

Para el presente proyecto se utilizarán programas para la predicción de sitios de unión a factores de transcripción, métodos de minería de datos y bases de datos para estudiar la relación entre los distintos dominios de conocimiento (cinética de la expresión génica, señales de expresión de genes putativos, función y conservación filogenética) con el objetivo de correlacionar las señales reguladoras en cis con patrones de expresión observados, predecir la función y estudiar la evolución de la red de regulación. El impacto de este trabajo será doble: en el campo de la investigación en virología, y en el desarrollo de métodos para obtener información de elementos reguladores en cis presentes en la región upstream (secuencia arriba) de las secuencias génicas, en particular la identificación de combinaciones funcionales de sitios o distintivos reguladores. Las predicciones computacionales de las interacciones reguladoras proteína-ADN en genomas del virus herpes serán validadas experimentalmente mediante la tecnología chIP-chip.